Несмотря на то, что в DOOM II нет классических эпизодов, их можно условно разделить на три тематические группы по окружению и фону неба:
Группа 1: Подземные базы и аванпосты (MAP01–MAP11) — локации напоминают военные и технические комплексы космопорта.
Группа 2: Городские руины (MAP12–MAP20) — действие переносится в разрушенные города Земли: улицы, жилые кварталы, промышленные зоны.
Группа 3: Ад (MAP21–MAP30) — финальная треть игры: сюрреалистичные, кошмарные пейзажи преисподней.
Секретные уровни (MAP31–MAP32) — отсылки к Wolfenstein 3D.